用SwissADME网站测试药物性质的原理PPT
引言SwissADME是一个用于评估化合物药物性质的在线工具,它提供了多个功能模块,包括吸收、分布、代谢和排泄(ADME)性质的预测。在药物研发过程中,...
引言SwissADME是一个用于评估化合物药物性质的在线工具,它提供了多个功能模块,包括吸收、分布、代谢和排泄(ADME)性质的预测。在药物研发过程中,了解药物的ADME性质对于评估其药理活性、毒性和药代动力学至关重要。本文将介绍SwissADME网站如何测试药物性质以及其原理。 SwissADME网站的概述SwissADME(http://www.swissadme.ch)是由瑞士洛桑联邦理工学院和洛桑大学合作开发的免费在线工具。它基于从已知化合物的数据库中提取的结构活性关系模型,使用机器学习算法来预测药物的各种ADME性质。SwissADME网站提供了一个用户友好的界面,用户只需输入化合物的化学结构,即可获得该化合物的各种ADME性质的预测结果。 测试药物吸收性质的原理吸收是药物进入体内的第一个步骤,它决定了药物是否能够通过生物膜进入血液循环。SwissADME使用了多个吸收性质的预测模型,包括血脑屏障透过性、脂肪酸结合蛋白亲和性、人类肠上皮细胞渗透性等。这些模型是通过对已知化合物的实验数据进行训练和验证得到的。用户在SwissADME网站上输入化合物的结构后,该网站将使用内置的模型对化合物的ADME性质进行预测。对于吸收性质的预测,SwissADME会根据输入的化合物结构计算一系列分子描述符,例如分子质量、脂溶性、水溶性等。然后,这些分子描述符将与预先训练的模型进行比较,以预测该化合物在吸收方面的表现。预测的准确性受到多个因素的影响,例如模型的训练数据质量、化合物的结构多样性和模型的算法等。因此,虽然SwissADME提供了方便快速的预测结果,但这些结果仅作为参考,仍需进行实验验证。 其他ADME性质的预测除了吸收性质,SwissADME还可预测药物的其他ADME性质,包括分布、代谢和排泄性质。药物分布性质预测模型可用于预测药物在体内的组织分布情况。药物代谢性质预测模型可用于预测药物在体内的代谢反应类型和代谢程度。药物排泄性质预测模型可用于预测药物在体内的排泄途径和速率。这些模型的原理与吸收性质预测类似,都是通过计算化合物的分子描述符并与已知数据进行比较,从而预测药物的性质。 结论SwissADME网站提供了一个方便快捷的平台,用于测试药物的ADME性质。通过输入化合物的结构,用户可以获得该化合物的各种ADME性质的预测结果。这些预测结果对于药物研发和评估具有重要意义。然而,预测结果仅作为参考,仍需进行实验验证。在使用SwissADME网站进行药物性质预测时,研究人员应该结合实验结果和其他相关信息进行综合分析和判断。参考文献[1] Daina, A., Michielin, O. & Zoete, V. SwissADME: a free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Sci. Rep. 7, 42717 (2017).[2] Daina, A., Michielin, O. & Zoete, V. SwissTargetPrediction: updated data and new features for efficient prediction of protein targets of small molecules. Nucleic Acids Res. 47, W357–W364 (2019).