从猪肉组织中提取猪DNA基因组PPT
猪作为重要的家畜,其DNA基因组研究对于提高养殖业产量、改善肉质和疾病抵抗力等方面具有重要意义。随着基因组学技术的发展,提取高质量的猪DNA基因组成为进行...
猪作为重要的家畜,其DNA基因组研究对于提高养殖业产量、改善肉质和疾病抵抗力等方面具有重要意义。随着基因组学技术的发展,提取高质量的猪DNA基因组成为进行这些研究的前提条件。下面将介绍从猪肉组织中提取猪DNA基因组的步骤和注意事项。材料准备在进行DNA提取之前,需要准备以下材料:猪肉组织样本低温冰箱液氮研钵和研杵离心管和盖子DNase-free的超纯水10% Tween 20SDS(十二烷基硫酸钠)无水乙醇氯仿异戊醇5M NaCl溶液0.5M EDTA溶液0.1MTris-HCl(pH=8.0)0.01M KCl溶液Taq DNA聚合酶和dNTPsDNA凝胶电泳试剂DNA Marker、1×TAE、GoldView、2×TS Taq Master Mix等提取步骤样品准备选取新鲜的猪肉组织样本,用液氮迅速冷冻并保存于低温冰箱中。将样品切成小块,约100mg左右,方便后续的研磨和提取研磨将切好的猪肉组织块放入研钵中,加入适量的石英砂和研杵一起研磨至粉末状。这一步的目的是将组织细胞破碎,释放出其中的DNA细胞裂解将研磨好的粉末转移到离心管中,加入10% Tween 20和适量的SDS,充分混合后置于65℃水浴中温浴15分钟。这一步的目的是裂解细胞,释放出DNA。注意控制水浴温度和时间,避免温度过高或时间过长导致DNA降解去除杂质加入等体积的氯仿和异戊醇,充分混合后静置5分钟,使水相和有机相分离。弃去有机相,保留水相。这一步的目的是去除蛋白质等杂质。重复此步骤两次,确保去除大部分杂质沉淀DNA在水相中加入适量的无水乙醇和0.1M EDTA,充分混合后置于冰箱中静置1小时。这一步的目的是使DNA沉淀并从水相中析出。之后,将离心管置于离心机中,以12000rpm(约1340g)离心10分钟,收集沉淀的DNA洗涤DNA将收集到的DNA沉淀用70%乙醇清洗两次,去除残余的杂质和乙醇。最后将DNA沉淀晾干溶解DNA在DNA沉淀中加入适量的5M NaCl溶液和0.5M EDTA溶液,充分溶解后置于65℃水浴中温浴10分钟。这一步的目的是使DNA完全溶解于溶液中。之后,将溶液转移到离心管中,以12000rpm(约1340g)离心10分钟,去除不溶于水的杂质纯化DNA将上一步得到的溶液通过柱式PCR纯化试剂盒进行纯化。这一步的目的是进一步去除溶液中的杂质和小片段的DNA。纯化后的DNA可以用于后续的PCR扩增或电泳检测等实验PCR扩增根据需要选择合适的引物进行PCR扩增,以验证提取的DNA质量和数量是否符合要求。PCR反应体系中应包含Taq DNA聚合酶、dNTPs、引物和适量的模板DNA。反应程序通常包括预变性、变性、延伸和变性等步骤。结束后,通过电泳检测PCR产物的质量和大小是否符合预期电泳检测将PCR产物进行电泳检测,观察结果并拍照记录。通过与标准Marker的比较,可以大致判断提取的DNA质量和大小是否符合预期。同时也可以观察到是否存在其他杂带或污染等情况